Die Entwicklung von neuen mikrobiellen Produktionsstämmen und biotechnologischen Verfahren zur Herstellung von Aminosäuren, Feinchemikalien und neuen Produkten sowie die Etablierung der mikrobiellen Systembio(techno)logie stehen zusammen mit Grundlagenforschung im Mittelpunkt der Arbeiten am Institut für Bio- und Geowissenschaften - Biotechnologie (IBG-1). In der Arbeitsgruppe “Genomik und Expression“ spielt dabei das Essigsäurebakterium Gluconobacter oxydans eine große Rolle. Dieser vielseitige und industriell genutzte Mikroorganismus besitzt die Fähigkeit eine Vielzahl von Zuckern, Zuckeralkoholen und anderen Substraten im Periplasma durch membrangebundene Dehydrogenasen regio- und stereoselektiv unvollständig zu oxidieren und die resultierenden Produkte in das Kulturmedium freizusetzen. Daher wird G. oxydans industriell für verschiedene oxidative Biotransformationen verwendet. Wir haben kürzlich die ersten regulierbaren Genexpressionssysteme beschrieben, die in G. oxydans funktional sind (PMID 33856535, 32974745, 36060754). In einem Drittmittelprojekt sollen diese nun genutzt werden und in G. oxydans zur dynamischen Steuerung zellulärer Funktionen und für neue Screening- und Bioprozesstechnikstrategien etabliert werden.
Ihre Aufgaben:
Die von uns für G. oxydans vor kurzem beschriebenen ersten regulierbaren Genexpressionssysteme, die in Gluconobacter funktional sind, erlauben nun die Etablierung optogenetischer Werkzeuge zur dynamischen Steuerung zellulärer Funktionen und neue Screening- und Bioprozesstechnikstrategien zur Verbesserung von bestehenden und zur Etablierung neuer Prozesse mit G. oxydans.
Im BioSC Drittmittel-Projekt “OpTooGlu“ https://www.biosc.de/OpTooGlu arbeiten Sie an der Etablierung der Nutzung Licht-aktivierbarer “caged inducer“ als optogenetische Werkzeuge für die zeitlich-gesteuerte Genexpression in G. oxydans sowie der Charakterisierung dieser Tools in einfarbigen und zweifarbigen Bioprozess-Engineering-Strategien als Proof-of-Concept und zur Prozessverbesserung bei ausgesuchten Anwendungsbeispielen.
Die Arbeiten umfassen im Wesentlichen
- Klonierungen sowie Stamm- und Expressionssystem-Charakterisierungen (Enzym/Reporter-Assays, BioLector, Schüttelkolben, Bioreaktor/Fermenter) inklusive Substrat- und Produktanalytik (HPLC, NMR) in der AG “Genomics and Expression“ https://www.fz-juelich.de/en/ibg/ibg-1/research/systemic-microbiology/genomics-and-expression
- Stamm- und Expressionssystem-Charakterisierungen auf Einzelzellebene mittels Mikrofluidik in der AG “Microscale Bioengineering“ https://www.fz-juelich.de/en/ibg/ibg-1/researchgroups/systems-biotechnology/microscale-bioengineering
- Enger Austausch mit den Projektpartnern an der Heinrich Heine Universität Düsseldorf (IBOC, Prof. Dr. Jörg Pietruszka, https://www.iboc.uni-duesseldorf.de/unser-team sowie IMET, Prof. Dr. Thomas Drepper, https://www.iet.uni-duesseldorf.de/team , die ebenfalls auf dem Campus des Forschungszentrums Jülich angesiedelt sind.
- Verfassen wissenschaftlicher Publikationen
Ihr Profil:
- Master (of science / engineering) mit anschließender Promotion im Bereich der Biotechnologie / Mikrobiologie / Molekularbiologie / Bioingenieurwesen oder verwandte Gebiete mit einschlägigen und nachgewiesenen relevanten Erfahrungen
- Großes Interesse an molekularer Mikrobiologie und Biotechnologie
- Zielstrebige, aufgabenorientierte und zuverlässige Arbeitsweise
- Ausgeprägte Schreib- und Kommunikationsfähigkeiten (Deutsch und Englisch)
- Freude und Fähigkeit zur Zusammenarbeit
Unser Angebot:
Wir arbeiten an hochaktuellen gesellschaftlich relevanten Themen und bieten Ihnen die Möglichkeit, den Wandel aktiv mitzugestalten! Wir unterstützen Sie in Ihrer Arbeit durch:
- Integration in ein weltweit führendes Forschungsinstitut auf dem Gebiet mit einem anregenden wissenschaftlichen Umfeld
- Möglichkeit zur Entwicklung eines eigenen Erfahrungsprofils in dem Thema
- Einen großen Forschungscampus im Grünen, der beste Möglichkeiten zur Vernetzung mit Kolleginnen und Kollegen sowie zum sportlichen Ausgleich neben der Arbeit bietet
- Verschiedene Trainingsangebote und individuelle Möglichkeiten zur persönlichen und fachlichen Weiterentwicklung
- Flexible Arbeitszeitmodelle, attraktive Gleitzeitgestaltung sowie eine Vollzeittätigkeit, die auch vollzeitnah ( https://go.fzj.de/vollzeitnah ) ausgeübt werden kann
- 30 Tage Urlaub sowie eine attraktive Brückentagsregelung
Optimale Voraussetzungen zur Vereinbarkeit von Beruf und Privatleben sowie eine familienbewusste Unternehmenspolitik unterstützt durch unser Büro für Chancengleichheit https://go.fzj.de/VereinbarkeitvonBerufundFamilie
Wir bieten Ihnen eine spannende und abwechslungsreiche Aufgabe in einem interdisziplinären Arbeitsumfeld. Die Stelle ist verfügbar ab 01/2025 und befristet bis 12/2025 (ggf. verlängerbar bis 03/2026). Vergütung und Sozialleistungen erfolgen in Abhängigkeit von den vorhandenen Qualifikationen und je nach Aufgabenübertragung im Bereich der Entgeltgruppe 13 nach dem Tarifvertrag für den öffentlichen Dienst (TVöD-Bund).
Neben spannenden Aufgaben und einem kollegialen Miteinander bieten wir Ihnen noch viel mehr: https://go.fzj.de/Benefits
Wir freuen uns über Bewerbungen von Menschen mit vielfältigen Hintergründen, z.B. hinsichtlich Alter, Geschlecht, Behinderung, sexueller Orientierung / Identität sowie sozialer, ethnischer und religiöser Herkunft. Ein chancengerechtes, diverses und inklusives Arbeitsumfeld, in dem alle ihre Potentiale verwirklichen können, ist uns wichtig.
