Die Entwicklung von neuen mikrobiellen Produktionsstämmen und biotechnologischen Verfahren zur Herstellung von Aminosäuren, Feinchemikalien und neuen Produkten sowie die Etablierung der mikrobiellen Systembio(techno)logie stehen zusammen mit Grundlagenforschung im Mittelpunkt der Arbeiten am Institut für Bio- und Geowissenschaften - Biotechnologie (IBG-1). In der Arbeitsgruppe “Genomik und Expression“ spielt dabei das Essigsäurebakterium Gluconobacter oxydans eine große Rolle, für das kürzlich die ersten regulierbaren Genexpressionssysteme beschrieben wurden, die in Gluconobacter funktional sind und in Zukunft angewendet werden (PMID 33856535, 32974745, 36060754). Im Zuge weiterer Arbeiten dazu bieten wir Ihnen ab sofort eine Masterarbeit in einem Drittmittel-geförderten Projekt an.
Ihre Aufgaben:
Das vielseitige und industriell genutzte Essigsäurebakterium Gluconobacter oxydans besitzt die Fähigkeit eine Vielzahl von Zuckern, Zuckeralkoholen und anderen Substraten im Periplasma durch membrangebundene Dehydrogenasen regio- und stereoselektiv unvollständig zu oxidieren und die resultierenden Produkte in das Kulturmedium freizusetzen. Daher wird G. oxydans industriell für verschiedene oxidative Biotransformationen verwendet.
Die von uns für G. oxydans vor kurzem beschriebenen ersten regulierbaren Genexpressionssysteme, die in Gluconobacter funktional sind, erlauben nun die Etablierung optogenetischer Werkzeuge zur dynamischen Steuerung zellulärer Funktionen und neue Screening- und Bioprozesstechnikstrategien zur Verbesserung von bestehenden und zur Etablierung neuer Prozesse mit G. oxydans.
Im BioSC Drittmittel-Projekt “OpTooGlu“ ( https://www.biosc.de/OpTooGlu ) arbeiten wir nun an der Etablierung der Nutzung Licht-aktivierbarer “caged inducer“ als optogenetische Werkzeuge für die zeitlich-gesteuerte Genexpression in G. oxydans und den Einsatz dieser Tools in einfarbigen und zweifarbigen Bioprozess-Engineering-Strategien als Proof-of-Concept und zur Prozessverbesserung bei ausgesuchten Anwendungsbeispielen.
Im Zuge dieser Arbeiten sollen in der geplanten Masterarbeit erforderliche Klonierungen, Kultivierungen, BioLector-Assays und Screenings zur Stammentwicklung und Stammcharakterisierung inklusive Datenanalysen durchgeführt werden.
Ihr Profil:
- Sie studieren (im Master) Biotechnologie / Mikrobiologie / Molekularbiologie / Biochemie / Biologie oder eine verwandte Disziplin
- Sie konnten bereits Erfahrungen bei der Arbeit im Labor sammeln, z.B. bei Praktika
- Sie sind bereit, sich in ggf. für Sie neue Methoden einzuarbeiten (z.B. Gibson-Klonierungen, Kultivierungen, BioLector, Datenanalysen) einzuarbeiten und/oder bringen bereits Vorkenntnisse in diesen Bereichen mit.
- Sie sind an Laborarbeit und an der Optimierung biotechnologischer Prozesse interessiert.
- Sie besitzen ein hohes Maß an Selbstständigkeit, Motivation und Zuverlässigkeit.
- Sie zeigen eine sehr strukturierte, proaktive und ordentliche Arbeitsweise.
Unser Angebot:
Wir arbeiten an hochaktuellen innovativen Themen und bieten Ihnen die Möglichkeit, den Wandel aktiv mitzugestalten! Wir bieten Ihnen:
- Integration in ein weltweit führendes Forschungsinstitut auf dem Gebiet mit einem anregenden wissenschaftlichen Umfeld
- Möglichkeit zur Entwicklung eines eigenen Erfahrungsprofils in dem Thema
- Eigenverantwortliche Vorbereitung und Durchführung der übertragenen Aufgaben.
- Die Möglichkeit zum (orts-)flexiblen Arbeiten, z.B. tlw. im Homeoffice.
einen großen Forschungscampus im Grünen, der beste Möglichkeiten zur Vernetzung mit Kolleginnen und Kollegen sowie zum sportlichen Ausgleich neben der Arbeit bietet
Wir bieten Ihnen eine spannende und abwechslungsreiche Aufgabe in einem interdisziplinären Arbeitsumfeld. Die Masterarbeit ist ab sofort verfügbar.
Neben spannenden Aufgaben und einem kollegialen Miteinander bieten wir Ihnen noch viel mehr: https://go.fzj.de/Benefits
Wir freuen uns über Bewerbungen von Menschen mit vielfältigen Hintergründen, z.B. hinsichtlich Alter, Geschlecht, Behinderung, sexueller Orientierung / Identität sowie sozialer, ethnischer und religiöser Herkunft. Ein chancengerechtes, diverses und inklusives Arbeitsumfeld, in dem alle ihre Potentiale verwirklichen können, ist uns wichtig.
